Ogrzewanie pelletem przy użyciu palnika ATMOS A45, ma wiele wspólnego z ogrzewaniem za pomocą gazu lub oleju. Podstawową różnicą przy spalaniu pelletu jest to, że powstaje niewielka ilość popiołu, który trzeba usunąć z palnika oraz kotła w określonych odstępach czasu aby zapobiec osłabieniu wydajności lub funkcjonalności palnika. Palnik pelletu ATMOS A45 dostarczany jest w standardzie z automatycznym zapalnikiem paliwa. Palnik wraz z podajnikiem i zasobnikiem na pellety pracuje całkowicie automatycznie podczas użytkowania i sterowany jest elektronicznie przy użyciu czujnika płomienia(fotokomórka). Paliwo i powietrze dostarczane jest do palnika w sposób zapewniający maksymalną wydajność spalania. Palnik przeznaczony jest wyłącznie do spalania pelletu wysokiej jakości, o średnicy 6 - 8 mm i długości 10 - 25 mm. Pellet wysokiej jakości oznacza, że został wykonany z miękkiego drewna bez kory, tzw. „biały pellet”.
Popiół z palnika wybierany jest standardowo raz na 7 do 30 dni w zależności od potrzeb. Zaleca się czyszczenie wewnętrznych części palnika raz na rok; do wykonania tej czynności, palnik powinien zostać zdemontowany z kotła. Dla idealnego wyczyszczenia komory spalania palnika, można użyć specjalnego odkurzacza lub pogrzebacza.